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香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘一贤 1 ; 周端咏 1 ; 毛超 1 ; 汪军 1 ; 黄俊生 1 ;

作者机构： 1.海南大学环境与植物保护学院

关键词： 香蕉枯萎病菌;生理小种;SNF1基因;细胞壁降解酶;致病性

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2012 年 39 卷 21 期

页码： 160-164

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOC1和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白进行氨基酸序列比对和分析。研究结果显示,2个生理小种的SNF1基因的ORF分别为2 136、2 130 bp,二者相差6个碱基,同源性为99.5%。FOC1和FOC4的SNF1基因分别编码711、709个氨基酸,相差两个氨基酸,为丝氨酸(FOC1)和谷氨酰胺(FOC1)。生物信息学软件预测结果表明该蛋白N端不存在信号肽,但具有两个相同的功能结构域位点,分子量约为79 ku,pI为6.80。

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