文献类型： 中文期刊
作者： 漆艳香 1 ; 蒲金基 1 ; 张欣 1 ; 陆英 1 ; 张贺 1 ; 张辉强 1 ; 谢艺贤 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
关键词： 芒果细菌性黑斑病菌;群体感应;XcmR;生物信息学
期刊名称： 热带作物学报
ISSN： 1000-2561
年卷期： 2011 年 32 卷 04 期
页码： 92-96
收录情况： CSCD
摘要： 根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF/XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)中获得了约1.4 kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明,该基因片段长1 422 bp含有一个完整的LuxR同源基因,并命名为XcmR。生物信息学分析表明,XcmR基因完整ORF(开放阅读框)全长765 bp,编码254个氨基酸,分子质量和等电点分别约为28.2 ku和8.9,与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhyR/AsaR氨基酸序列具有86%~99%相似性。系统聚类结果表明,XcmR与来源于柑桔溃疡病菌(X.axonopodis pv.citri)、番茄疮痂病菌(X.c.pv.vesicatoria)、水稻白叶枯菌(X.oryzae pv.oryzae)和甘蓝黑腐病菌(X.c.pv.campestris)的LuxR蛋白聚成一支。NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明,XcmR是LuxR蛋白家族的一员,具有LuxR蛋白相似结构。
- 相关文献
[1]芒果细菌性黑斑病病菌rep-PCR遗传多样性. 漆艳香,张贺,蒲金基,张欣,谢艺贤,陆英,喻群芳,张辉强. 2017
[2]细菌的群体感应及其信号分子. 温晓芳,黄俊生. 2005
[3]群体感应机制在生防细菌筛选中的应用. 黄华平,代鹏,唐复润,邓国平,黄俊生. 2006
[4]植物DNA甲基转移酶的生物信息学分析. 吴春太,李维国,高新生,张晓飞. 2010
[5]人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析. 齐兴柱,胡文婷,张俊芳,黄俊生,李军. 2010
[6]菠萝VOZ转录因子序列特征及其对非生物胁迫的响应. 夏杨,苏初连,晁骏,康浩,蒲金基,张贺. 2018
[7]菠萝AcoLFY1转录因子对非生物胁迫的应答响应. 晁骏,康浩,夏杨,苏初连,蒲金基,张贺. 2018
[8]小麦逆境胁迫相关基因TaCBL7的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,郑科,刘泽厚. 2013
[9]小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析. 黄鑫,夏百成,龙翔宇. 2016
[10]椰子蜡质合成相关基因的生物信息学及其表达分析. 朱聪,王富有,孙熹微,王永,张大鹏,石鹏,肖勇. 2022
[11]木薯FRK1类似基因的分离及表达分析. 吴金山,陆小静,王思琦,黄家权,张逸杰,贾迎雪,陈银华. 2023
[12]西红柿(Solanum lycopersicum)潜在内源性致敏蛋白的生物信息学筛选与分析. 黄静,贾瑞宗,朱方超,徐林,郭运玲,郭安平. 2017
[13]麻疯树叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶的BIBAC文库筛选及其生物信息学分析. 付瑜华,夏志强,王海燕,王文泉. 2012
[14]香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析. 王安邦,吴琼,舒海燕,许桂莺,苗红霞,柯建浩,贾彩虹,邢文婷,许奕. 2016
[15]油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析. 杨蒙迪,金龙飞,周丽霞,窦雅静,曹红星,李新国. 2021
[16]基于GSS序列的猴面花miRNA生物信息学研究. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014
[17]杧果MiNPR1抗病基因克隆及生物信息学分析. 陈思宇,詹儒林,姜成东,柳凤,张国辉,姚全胜. 2023
[18]14-3-3蛋白结构与功能预测及其在木薯成熟期的表达分析. 潘冉冉,秦于玲,乔景娟,赖杭桂,陈松笔. 2018
[19]小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,杨丽娟,郑科,刘泽厚. 2014
[20]油棕EgGRF转录因子家族的全基因组鉴定与表达分析. 金龙飞,尹欣幸,曹红星. 2021
作者其他论文 更多>>
-
香蕉新品种"宝岛蕉"的选育及关键栽培技术
作者：程世敏;赵明;张欣;谢子四;苏祖祥;马源;谢艺贤;黄丽娜;魏守兴
关键词：香蕉;香蕉枯萎病;宝岛蕉;巴西蕉;抗性;栽培技术
-
445份杧果种质对细菌性黑斑病的抗性评价
作者：陈卓立;罗睿雄;赵志常;余东;高爱平;张贺
关键词：杧果;种质;细菌性黑斑病;离体叶片接种;病情指数;高抗
-
柱花草胶孢炭疽菌转录因子CgHapX的克隆及生物信息学分析
作者：陆英;张巍懿;贺春萍;梁艳琼;黄兴;易克贤;吴伟怀
关键词：柱花草;CgHapX;基因克隆;生物信息学
-
热带作物主要病虫害综合防治理论与技术研究进展
作者：徐雪莲;蒲金基;王树昌
关键词：热带作物病虫害;抗病虫;监测预报;关键防控技术;综合防治
-
芒果细菌性黑斑病病原菌Ⅲ型分泌系统hrpF基因功能分析
作者：喻群芳;张贺;漆艳香;曾凡云;蒲金基
关键词：芒果细菌性黑斑病;柑橘黄单胞菌芒果致病变种;hrpF基因;Ⅲ型分泌系统;基因表达
-
咖啡叶枯病病原鉴定、生物学特性及化学药剂筛选研究
作者：范艳妮;贺春萍;吴伟怀;梁艳琼;易克贤;陆英
关键词：咖啡叶枯病;塔利间座壳菌;多基因序列分析;生物学特性;室内毒力测定
-
芒果炭疽病及其抗性相关基因研究进展
作者：王好;张贺;罗睿雄;赵志常;苏晓红;黄璐瑶;陈文雄;高爱平
关键词：芒果;芒果炭疽病;抗病基因;遗传育种
