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大白菜花蕾败育相关基因的cDNA-AFLP差异表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张鲁刚 1 ; 贾晋 2 ; 张少丽 1 ; 张玉 1 ;

作者机构: 1.西北农林科技大学园艺学院

2.甘肃省农业科学院

关键词: 大白菜;花蕾败育;cDNA-AFLP技术;ESTs

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2010 年 18 卷 03 期

页码: 87-90

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究以大白菜(Brassica campestris ssp.pekinensis(Lour.)Olsson)败育花蕾到正常花蕾的10个连续时期的花蕾为材料,采用cDNA-AFLP技术和生物信息学分析等方法研究了败蕾过程中的基因表达差异,获得了192个大白菜败蕾相关差异表达片段,随机挑选88个序列进行测序,获得72个新表达序列标签(ESTs),将长度大于100bp的67个ESTs在GenBank进行了登录,登录号为GR308155-GR308221。根据生物信息学分析结果,其中Blastx比对分值大于80的62条ESTs可分为能量和新陈代谢、膜和运输、转录和翻译、氨基酸合成和加工、信号传导、防御及分类不确定7类。其中EST46、EST3-1、EST13-2、EST20-1和EST30-2等5个ESTs为大白菜花蕾败育材料中新发现的。

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