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霍山石斛托品酮还原酶基因的克隆及其表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林榕燕 1 ; 叶秀仙 2 ; 钟淮钦 2 ; 黄敏玲 3 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院作物研究所;福建省农业科学院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技术研究中心

2.;福建省农业科学院作物研究所;福建省农业科学院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技术研究中心

3.;福建省农业科学院作物研究所;福建省农业科学院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技术研究中心;

关键词： 霍山石斛;托品酮还原酶;基因克隆;qPCR

期刊名称： 中国细胞生物学学报

ISSN： 1674-7666

年卷期： 2017 年 09 期

页码： 1196-1206

收录情况： CSCD

摘要： 为了探究托品酮还原酶(tropinone reductase,TR)基因在石斛中的功能,该研究采用RT-PCR结合RACE技术,以霍山石斛原球茎为材料,克隆得到霍山石斛TR-I基因的cDNA序列,其在Gen Bank中的登录号为KY912085。TR-I基因的cDNA长1 043 bp,包含一个完整的共807 bp的ORF(open reading frame)(79-885),共编码268个氨基酸。生物信息学分析表明,该蛋白质可能是一种疏水性稳定蛋白质,无信号肽,不含卷曲螺旋结构,具有14个功能位点、47个潜在磷酸化位点,其二级结构由螺旋、折叠和卷曲结构组成。系统进化树分析表明,霍山石斛TR-I与铁皮石斛、金钗石斛的亲缘关系较近,处于同一分支。qPCR结果显示,TR-I基因在霍山石斛不同生长期的相对表达量均表现为茎>叶>根,且茎和叶中TR-I的表达量均随着生长期的延长呈现低–高–低的变化趋势;在不同品种中,金钗石斛的TR-I基因相对表达量最高,铁皮石斛中最低;不同浓度茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,Me JA)处理比较,100μmol/L茉莉酸甲酯处理下TR-I基因表达量最高,推测该基因可能参与霍山石斛生物碱的合成途径。

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