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棉花生长素结合蛋白ABP1基因cDNA的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙建波 1 ; 崔百明 1 ; 刘德兵 1 ; 彭明 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带生物技术国家重点实验室

关键词： 棉花;ABP1;基因克隆;基因分析

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2007 年 19 卷 04 期

页码： 5-9

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 生长素结合蛋白(ABP1)在植物细胞发育中起着重要作用。在ABP1蛋白的保守区设计引物,利用RT-PCR和RACE方法,首次克隆了棉花ABP1基因cDNA的3′和5′末端。测序及生物信息学分析表明,该基因cDNA全长824 bp编码190个氨基酸,它所编码的氨基酸序列包含植物ABP1蛋白家族的所有特征,被命名为GhABP1。棉花ABP1所包含的BoxA,Box B和Box C区在植物ABP1家族中是高度保守的。它的C末端氨基酸残基WDE在蛋白质的折叠及ABP1在质膜上的功能活性方面都具有重要的作用。棉花ABP1的C末端带有KDEL残基区,这个KDEL区表明它被定位在内质网上。用Clustal W软件进行多重比对分析表明,棉花ABP1与拟南芥、向日葵、油菜、辣椒、甘菊的氨基酸序列同源性分别为72%,72%,71%,70%和70%。系统进化分析表明,棉花在进化上与萝卜、拟南芥和油菜聚为一类。序列分析表明此基因为生长素结合蛋白基因家族的新成员。

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