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河北省石家庄市番茄黄化曲叶病毒及其伴随DNAβ的分子鉴定及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 韩旭良 1 ; 康忱 2 ; 田哲娟 2 ; 王鹏 2 ; 李亚栋 2 ; 赵雪芳 2 ; 闫洪波 1 ; 刘美霞 3 ; 吴志明 2 ;

作者机构: 1.河北经贸大学

2.河北省农林科学院经济作物研究所

3.山东省寿光市圣城街道办事处

关键词: 番茄黄化曲叶病毒;DNAβ;分子鉴定;序列分析

期刊名称: 河北农业科学

ISSN: 1008-1631

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 74-82

摘要: 在河北石家庄市的番茄上分离得到番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)及其伴随卫星DNA (Betasatellite DNA,又称DNAβ),对其进行分子鉴定及序列分析,明确TYLCV石家庄分离物及其伴随DNAβ分子结构特征及其进化起源。根据已报道的TYLCV及其伴随DNAβ序列设计引物,分别扩增TYLCV石家庄分离物及其伴随DNAβ的全长序列并测序。在NCBI上选取国内外有代表性的TYLCV序列和DNAβ序列,使用MEGA 6.0软件和DNAMAN软件对石家庄TYLCV分离物及其伴随DNAβ进行遗传变异分析。结果表明:TYLCV石家庄分离物全长为2 781 bp,共有6个ORFs,将该分离物定名为TYLCV-SJZ2021。基因组序列比对发现,TYLCV-SJZ2021与山东省的分离物同源性最高(99%);与2015年本实验室报道的TYLCV石家庄分离物相似度为98.67%,存在37处碱基差异,均属于TYLCV以色列株系。TYLCV-SJZ2021的伴随DNAβ全长1 343 bp,其上有病毒在细胞间移动相关蛋白的BC1编码区,序列比对发现该DNAβ与河南TYLCV伴随DNAβ分子最为相似(98%)。从分子水平上鉴定了TYLCV-SJZ2021及其伴随DNAβ的分类地位,为防治该病毒病害及其抗病育种奠定了基础。

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