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结缕草属种质资源EST-SSR遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄春琼 1 ; 何潇 1 ; 罗丽娟 2 ; 董荣书 1 ; 刘国道 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室

2.海南大学热带作物学院

关键词： 结缕草属;EST-SSR;分子标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2024 年 32 卷 008 期

页码： 2386-2393

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以43份不同来源的结缕草属种质为材料，利用表达序列标签-简单重复序列(Expressed Sequence Tag-Simple sequence repeat, EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析。结果表明：从125对EST-SSR引物中筛选出30对能稳定扩增、条带清晰的引物；共检测到124个标记，平均每对引物检测到4个，多态性标记有108个，多态性位点百分率为88.60%;种质间遗传相似性系数为0.530～0.864,平均为0.711;共检测到104个观察等位基因，平均每对引物检测到3个；有效等位基因数范围为0～5,平均为3;Shannon信息指数变化范围为0～1.593,平均为0.940。Nei’s基因多样性指数范围为0～0.793,平均为0.541;在遗传相似性系数为0.800时，利用非加权组平均法(Unweighted pair-group method with arithmetic means, UPGMA)法将43份种质划分为4个类群，聚类结果与种质地理位置有一定的关联，但联系不紧密。本研究结果表明43份种质的遗传多样性处于上等水平，EST-SSR标记能有效地评价结缕草属种质的遗传差异，为结缕草属种质资源的鉴定评价及分子标记辅助育种提供参考依据。

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