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槟榔DUR3基因鉴定及组织表达特异性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 曹皓玮 1 ; 周广振 1 ; 李佳 1 ;

作者机构： 1.海南大学热带作物学院;中国热带农业科学院椰子研究所

关键词： 槟榔(Areca cat);DUR3;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 023 期

页码： 7729-7736

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究DUR3家族基因在槟榔尿素转运过程中的作用,本研究利用拟南芥DUR3同源蛋白为探针序列,从槟榔基因组数据库中鉴定DUR3家族基因,利用生物信息学方法对其基因结构、进化关系、保守结构域、跨膜结构域和表达模式进行分析.结果表明,从槟榔基因组中共鉴定出2个DUR3基因,与其他植物的DUR3同源蛋白类似,具有15个跨膜结构域,其保守结构域和基序位置也高度相似.不同物种的DUR3氨基酸序列构建的进化树显示,双子叶植物和禾本科单子叶植物各聚为一支,而棕榈科单子叶的植物单独聚为一支,且与双子叶植物亲缘关系更近.DUR3直系同源基因的Ka/K,比值小于1,这表明这些物种的DUR3基因在物种进化中受到纯化选择压力.本研究为深入研究槟榔的DUR3基因的功能提供了理论依据.

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