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陆稻过氧化氢酶基因(OsCATB-lh)的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邢淑莲 1 ; 姚艳丽 1 ; 徐磊 1 ; 胡小文 1 ; 刘洋 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院湛江实验站/中国热带农业科学院热带旱作农业研究中心

关键词： 陆稻;过氧化氢酶;基因克隆;序列分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2015 年 42 卷 19 期

页码： 106-110

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入了解陆稻过氧化氢酶(CAT)基因的序列特点和生物信息学信息,以粳型陆稻品种泸旱3号为材料,利用同源克隆技术成功获得1条陆稻CAT基因序列(Gen Bank登录号:KR133179)。该序列全长1 739 bp,其中编码区ORF全长1 479 bp,编码492个氨基酸。生物信息学分析发现,此基因是位于水稻基因组第6号染色体的单拷贝基因。对其编码蛋白分析表明,其具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。与水稻CAT基因序列(Os CATB)进行比较发现,Os CATB-lh与水稻Os CATB基因核苷酸序列一致性达到99%,存在6个核苷酸差异位点;与水稻Os CATB蛋白序列一致性为99%,有3个氨基酸变异位点。

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