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橡胶树ADC1的克隆、表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 侯岚菲 1 ; 杨洪 1 ; 邓治 1 ; 代龙军 1 ; 门中华 1 ; 李德军 1 ;

作者机构: 1.包头师范学院生物科学与技术学院;中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室/海南省热带作物栽培生理学重点实验室

关键词: 橡胶树;精氨酸脱羧酶;基因克隆;生物信息学;实时荧光定量PCR

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2018 年 11 期

页码: 111-119

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 精氨酸脱羧酶(Arginine decarboxylase,ADC)是高等植物多胺合成的重要酶。为对橡胶树ADC基因表达模式及生物信息学进行分析,采用PCR和测序技术从橡胶树中克隆了一个ADC基因(HbADC1),获得的HbADC1序列长2 594 bp,开放阅读框为2 175 bp,编码724个氨基酸。生物信息学预测HbADC1理论分子量和等电点分别为77.7 kD和5.14。进化分析表明,HbADC1与大戟科植物木薯、麻风树的ADC聚为一支。qRT-PCR分析表明,HbADC1表达无组织特异性,在雌花中表达量最高,茎尖、雄花、叶片、树皮和胶乳次之。HbADC1在不同发育时期叶片中的表达存在变化,稳定期表达量最低,淡绿期最高,说明HbADC1可能参与橡胶树叶片发育过程。此外,HbADC1表达受伤害、低温、干旱、高盐、过氧化氢及乙烯调控,表明HbADC1可能参与橡胶树逆境胁迫和乙烯应答过程。

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