文献类型: 中文期刊
作者: 李亚军 1 ; 何金曼 1 ; 张秀霞 1 ; 邓晓东 1 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所
关键词: 小新月菱形藻;硅缺乏;转录组测序;差异表达基因;GO功能分类;KEGG富集分析;中心碳代谢;基因调控
期刊名称: 生物技术
ISSN: 1004-311X
年卷期: 2025 年 35 卷 001 期
页码: 25-29,94
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]分析硅缺乏对小新月菱形藻基因在转录水平上的调控。[方法]收集缺硅24 h和正常培养条件下的藻细胞,利用illumina NovaSeq 6000平台对其RNA进行测序。以正常培养藻细胞为对照,鉴定硅缺乏条件下差异表达基因,并对其进行GO和KEGG显著性富集分析。[结果]以对照相比,共鉴定出668个基因和1 306个基因在硅缺乏时分别上调和下调表达。GO显著性分析结果表明,差异表达基因显著性富集在38个GO条目中,主要与阴离子转运,膜组分及转录因子活性等相关。8个KEGG显著性富集通路主要与中心碳代谢等途径相关。进一步分析差异基因表达模式,发现与糖酵解相关基因均下调表达,碳代谢相关基因在硅缺乏时上调表达。[结论]硅缺乏诱导小新月菱形藻1 974个基因在转录水平上差异表达,其中,糖代谢相关基因下调表达,而碳代谢相关基因上调表达。
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