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北京地区芹菜细菌性软腐病菌鉴定及其致病力分析

文献类型: 中文期刊

作者: 田宇 1 ; 马亚丽 1 ; 何付新 1 ; 马荣才 2 ; 谢华 3 ;

作者机构: 1.北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室

2.北京农业生物技术研究中心

3.北京市农林科学院农业生物技术研究中心

关键词: 芹菜(Apium graveolens L.);细菌性软腐病;Pectobacterium carotovorum subsp.odoriferum;Pectobacteriumcarotovorum subsp.brasilience;鉴定;致病力

期刊名称: 植物病理学报

ISSN: 0412-0914

年卷期: 2016 年 46 卷 04 期

页码: 433-442

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对从北京地区芹菜软腐组织中分离到的37株细菌性软腐病菌株,进行了微生物碳源利用(BiologTM)、生化特性、特异性PCR、ITS-RFLP带型以及基于16S rDNA完整序列遗传关系分析。结果如下:菌株革兰氏染色阴性、具周生鞭毛;可在5%和7%NaCl及28℃和37℃条件下生长;可分解柠檬酸盐及液化明胶;Biolog分析将这些菌株均鉴定为Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum(Pcc)。生化特性分析发现,其中36株菌株能利用D-山梨醇、D-阿拉伯糖醇、异麦芽酮糖和α-甲基葡萄糖苷,与对照菌株P.carotovorum subsp.odoriferum(Pco)S7一致;另外1株菌株Q34不能利用上述糖醇,与对照菌株P.carotovorum subsp.brasilience(Pcb)BC1和P.carotovorum subsp.carotovorum(Pcc)ECC71表现一致。利用pel(pectate lyase)基因特异性引物Y1/Y2在所有的37株菌株中均扩增出预期片段(434 bp),表明其基因组中均含有果胶酶基因。Pcb特异性PCR引物BR1f/L1r仅在Q34菌株与Pcb BC1中扩增出预期片段(322 bp),而Pcc特异性PCR引物EXPCCF/EXPCCR则在除Pcb BC1外所有菌株中均扩增出预期片段(550 bp)。Rsa I酶切16S-23S rDNA ITS片段结果显示,Q34酶切带型与Pcb BC1相同,其余36株带型与Pcc ECC71和Pco S7相同。基于16S rDNA基因完整序列,以Dickeya dadantii菌株582为外群,该37株菌株与已发表的Pectobacterium菌株系统发育树聚类分析结果表明,Q34与已发表的其他Pcb菌株形成了明显的Pcb类群,其余36株菌株则与已发表的其他Pco菌株形成了明显的Pco类群。综合多种鉴定结果,36株被鉴定为Pco,Q34被鉴定为Pcb。菌株致病力测试结果显示,36株Pco菌株中仅Q47表现为低等的致病力,其余24株和11株分别表现为中等和高等致病力;Pcb菌株Q34则表现出中等致病力。

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