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基因表达分析稻瘟病菌中8个假定RhoGAP蛋白与几丁质合酶的关系

文献类型: 中文期刊

作者: 叶文雨 1 ; 豆献英 2 ; 陈美莲 3 ; 牛晓庆 4 ; 杨雪 2 ;

作者机构: 1.福建农林大学生命学院

2.福建农林大学生命学院福建农林大学植物保护学院中国热带农业科学院椰子研究所

3.福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室

4.中国热带农业科学院椰子研究所

关键词: 稻瘟病菌;RhoGAP;生物信息学;几丁质合酶;Real-time PCR

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2016 年 35 卷 10 期

页码: 2724-2729

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过分析稻瘟病菌Rho GAP家族基因与几丁质合酶家族基因的表达关系,研究该家族基因对细胞壁形成的影响。利用不同生物信息学软件对Rho GAP家族进行序列分析,运用RT-PCR技术获得了该家族基因的部分c DNA序列,通过实时荧光定量技术分析Rho GAP基因与几丁质合酶基因的表达关系。结果表明,稻瘟病菌数据库中8个Rho GAP基因均含有保守的GAP结构域,且为水溶性蛋白,蛋白分子量相对较大,系统进化分析结果显示,16个Rho GTP酶激活蛋白可分为两类;不同的几丁质合成酶基因在不同Rho GAP基因突变体中的表达量不同,总的趋势是上调的。说明Rho GAP基因家族蛋白可能参与了稻瘟病菌不同阶段细胞壁的合成,本结果为进一步研究Rho GAP家族基因参与多样性的代谢途径奠定了基础。

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