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感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 田保华 1 ; 王永勤 1 ; 王婵 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院蔬菜研究中心

关键词： 大葱;胡葱黄条病毒;外壳蛋白基因;克隆

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2012 年 1 卷 16 期

页码： 36-41

收录情况： 北大核心

摘要： 以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区碱基数均为774bp,均编码258个氨基酸;在该编码区内存在2个碱基的差异,编码的蛋白存在1个氨基酸的差异。系统进化树分析表明:SYSV分离物可以区分为两个主要群体,SYSV-CP1和SYSV-CP2位于第Ⅱ组内,它们与来自浙江的SYSV的分离物亲缘关系最近,表现出一定的地理分布相关性。

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