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基于转录组信息的艾纳香牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(BbGGPS)的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 夏奇峰 1 ; 赵致 2 ; 刘红昌 2 ; 官玲亮 2 ; 庞玉新 2 ;

作者机构： 1.贵州大学生命科学学院

2.贵州大学生命科学学院;贵州大学农学院贵州省中药材重点实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室/海南省艾纳香工程技术研究中心

关键词： 艾纳香;牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶;氨基酸序列;系统发育分析

期刊名称： 山地农业生物学报

ISSN： 1008-0457

年卷期： 2016 年 37 卷 04 期

页码： 23-29

摘要： 采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of c DNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera L·DC)的叶片中克隆到二萜化合物合成的关键酶牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(Bb GGPS)基因。结果显示:Bb GGPS基因的c DNA全长1475 bp,包含开放阅读框(ORF)1002 bp,编码334个氨基酸;亚细胞结构定位于叶绿体,既非膜蛋白也非分泌性蛋白。疏水性分析显示,Bb GGPS是亲水性蛋白。同源性比对结果显示,Bb GGPS蛋白与其他植物中GGPS蛋白具有高度的相似性。系统发育分析表明,所有序列被聚为5大类,Bb GGPS与菊科植物刺菜蓟聚(Cynara cardunculus var)为一类,表明与其亲缘关系最近。

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