文献类型： 中文期刊
作者： 冯建明 1 ; 郭绍贵 2 ; 吕桂云 3 ; 陈年来 1 ; 张海英 2 ; 宫国义 2 ; 许勇 2 ;
作者机构： 1.甘肃农业大学农学院
2.北京市农林科学院蔬菜研究中心
3.河北农业大学
关键词： 西瓜;枯萎病;EST;SSR
期刊名称： 华北农学报
ISSN： 1000-7091
年卷期： 2009 年 24 卷 03 期
页码： 91-95
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 对西瓜枯萎病菌生理小种1诱导的抑制差减杂交cDNA文库测序获得的4 000条EST进行分析,经过前处理后拼接得到1 487条unigene序列,全长为759 kb。在其中978条unigene序列中共检索出2 136个EST-SSR,出现频率为53.4%。EST-SSR的平均分布距离和平均长度分别是1/0.36 kb、19.59 bp。EST-SSRs中的重复单元以二核苷酸和三核苷酸重复为主,二者在总EST-SSRs中的出现频率为98.08%。GA/TC和GAA/TTC是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复的25.78%和12.97%。西瓜抗枯萎病相关EST资源的SSR信息分析为进一步建立西瓜EST-SSR标记和探索其在西瓜基因组学研究中的应用奠定了基础。
- 相关文献
[1]Comprehensive analysis of expressed sequence tags from cultivated and wild radish (Raphanus spp.). Shen, Di,Qiu, Yang,Li, Xixiang,Shen, Di,Sun, Honghe,Huang, Mingyun,Zheng, Yi,Fei, Zhangjun,Sun, Honghe,Fei, Zhangjun. 2013
[2]Latest Advances in Watermelon Genomics. Guo, Shaogui,Xu, Yong,Zhang, Haiying,Gong, Guoyi,Guo, Shaogui,Zheng, Yi,Fei, Zhangjun,Huang, Sanwen,Yi, Hongping,Wu, Mingzhu,Fei, Zhangjun,Zheng, Yi. 2010
[3]辣椒EST-SSR信息分析及标记开发. 张宇,张晓芬,陈斌,耿三省,李焕秀,李珍. 2010
[4]西瓜抗枯萎病基因同源序列的克隆与分析. 郭绍贵,宫国义,许勇,张海英,毛爱军. 2008
[5]西瓜枯萎病的研究进展. 张屹,魏林,许勇,梁志怀. 2013
[6]西瓜枯萎病菌生理小种1抗性基因连锁标记开发. 张屹,张海英,郭绍贵,任毅,张洁,耿丽华,梁志怀,许勇. 2013
[7]大白菜表达序列标签SSR标记分析. 葛佳,谢华,崔崇士,洪剑明,马荣才. 2005
[8]一种简单、快速克隆玉米功能基因的方法. 邹华文,朱玉梅,黄丛林,田小海. 2007
[9]不同居群马蔺种质材料同工酶酶谱特征分析. 李强栋,孟林,毛培春,张德罡. 2012
[10]一种简单、快速克隆玉米功能基因的方法. 邹华文,朱玉梅,黄丛林,田小海. 2007
[11]酯酶(EST)和酸性磷酸酯酶(ACP)同工酶电泳技术在绿菜花和西瓜F1代杂交种纯度检测中的应用. 李丽,郑晓鹰,邢宝田. 1999
[12]大白菜软腐病抗性相关基因分子标记的开发. 陈昌龙,赵雪,孙旺旺,李晓颖,田宇,李未然,谢华. 2019
[13]马蔺不同生长阶段嫩叶POD和EST同工酶分析. 李强栋,孟林,毛培春,张德罡,韩润英. 2011
[14]核桃EST-SSR信息分析与标记的初步建立. 朱艳,郝艳宾,王克建,吴春林,王维霞. 2009
[15]Phylogenetic Analysis and Expression Patterns of the MAPK Gene Family in Wheat (Triticum aestivum L.). Lian Wei-wei,Tang Yi-miao,Gao Shi-qing,Zhang Zhao,Zhao Xin,Zhao Chang-ping,Lian Wei-wei. 2012
[16]Identification and characterization of a subset of microRNAs in wheat (Triticum aestivum L.). Su, Chun,Gao, Shiqing,Tang, Yimiao,Zhao, Changping,Li, Lei,Su, Chun,Yang, Xiaozeng,Li, Lei.
[17]中国玉米品种标准DNA指纹库构建研究进展. 赵久然,王凤格,郭景伦. 2004
[18]黄瓜枯萎病接种方法及抗性遗传的研究. 周红梅,毛爱军,张丽蓉,张峰,王永健,杨文才. 2010
[19]黄瓜抗枯萎病基因连锁分析和定位. 周红梅,董从娟,张海英,任毅,郭绍贵. 2015
[20]番茄枯萎病抗性基因I-2的显性分子标记及其应用. 于拴仓,邹艳敏. 2007
作者其他论文 更多>>
-
黄瓜新品种华青40的选育
作者：魏美甜;程琳;黄洁;邱志军;程培明;许勇
关键词：黄瓜;新品种;华青40;选育
-
西瓜ClPP2C3克隆及表达分析
作者：朱毅;柳唐镜;宫国义;张洁;王晋芳;张海英
关键词：西瓜;ClPP2C3;基因克隆;亚细胞定位;启动子活性差异分析
-
瑞康盾微生物菌剂在秋季连作西瓜上的应用效果研究
作者：冯汝超;刘哲;郭绍贵;张丽娜;张洁;沈峰;郑佳秋;梅燚
关键词：瑞康盾微生物菌剂;秋季连作西瓜;产量;品质
-
解淀粉芽孢杆菌5号防控西瓜CGMMV机制初探
作者：吴琼;张甜甜;李茂营;吴慧玲;郭绍贵;张洁;任毅;张海英;宫国义
关键词：西瓜;黄瓜绿斑驳花叶病毒;解淀粉芽孢杆菌;生物防控
-
西瓜、甜瓜瓜亡革菌枯萎病及其致病性
作者：耿丽华;史越;宫国义;宋顺华
关键词：西瓜、甜瓜;枯萎病;病原菌;瓜亡革菌;致病性
-
海南地区冬春作甜瓜病毒病病原鉴定与分析
作者：柳唐镜;邱艳红;陈建军;王锋;许勇;叶云峰;张棵;王敏
关键词：甜瓜病毒病;甜瓜黄斑病毒;西瓜银斑驳病毒;中国南瓜曲叶病毒;分类鉴定
-
江苏盐城地区温室秋茬小型西瓜引种栽培试验
作者：冯汝超;郭绍贵;刘哲;马江黎;沈峰;尤春;张丽娜;郑佳秋;梅燚
关键词：小型西瓜;引种栽培;盐城地区;秋茬
