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基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杜文丽 1 ; 陈中钐 1 ; 许端祥 1 ; 高山 1 ; 温庆放 1 ;

作者机构： 1.福州市蔬菜科学研究所;福建省农业科学院作物所

关键词： 苦瓜;高温胁迫;Illumina HiSeq 2500测序;差异表达基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 02 期

页码： 377-387

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 高温胁迫时影响苦瓜作物产量及地域分布的重要限制因子,但由于其在非生物胁迫逆境方面的生物学信息研究进展较慢,这在一定程度上制约了苦瓜分子育种及品种改良工作。利用Illumina HiSeqTM2500高通量测序平台对高温胁迫处理前后的苦瓜叶片进行转录组测序,结果组装获得平均长度为700.75 bp共89 757条有效Unigene,N50长度达到1 239 bp;有48 662条Unigene获得注释信息,占全部Unigene的54.2%,与未处理的对照相比,共有2 254差异表达基因,其中672个上调,1 582下调表达。有27 116条Unigene能够注释到GO数据库,获得包含于细胞组分、分子功能和生物学过程三大类内共135 967个GO的功能注释,并且差异表达基因的GO功能注释分类情况大致与之相似。进一步筛选到可能与高温胁迫相关的基因,包括HSP,HSF等家族基因。本研究是首次对高温胁迫下的苦瓜叶片转录组进行分析,为进一步开展苦瓜耐高温分子生物学层面研究提供大量参考信息。

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