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石仙桃中4种转录因子鉴定及其组织表达的研究

文献类型： 中文期刊

作者： 刘保财 1 ; 张武君 1 ; 赵云青 1 ; 黄颖桢 1 ; 陈菁瑛 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院作物研究所

关键词： 石仙桃;C2H2;bHLH;WRKY;bZIP;理化特性;组织表达

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 141-152

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】石仙桃Pholidota chinensis Lindl为珍稀濒危的附生兰，附生较地生而言进化出了许多特殊的形态结构和生理生化特性，而转录因子对调控植物的生长发育具有作用，旨在探讨和发掘石仙桃中调控其生长发育的转录因子。【方法】利用PacBio和Illumina测序技术获得石仙桃的全长转录组数据以及在根、根状茎、假鳞茎和叶片中的基因表达量，通过进一步生信分析，探讨石仙桃4种转录因子家族成员、理化特性及其组织表达特异性，并用氯化钠（NaCl）和茉莉酸甲酯（MeJA）诱导逆境胁迫，用RT-qPCR分析了C2H2家族和bHLH家族的表达量。【结果】石仙桃中鉴定的4种转录因子及其家族成员转录本为：C2H2家族21个、bHLH家族27个、WRKY家族30个、bZIP家族19个，这4个家族及其成员主要为亲水的不稳定性蛋白，亚细胞定位主要位于细胞核内，bHLH家族的部分成员位于细胞质、叶绿体等细胞器中，各基因家族均具有典型的保守结构域特征，在石仙桃的根、根状茎、假鳞茎和叶片呈现出明显的组织特异性。21个C2H2家族和27个bHLH家族中所有基因表达均受NaCl和MeJA影响，但家族成员受到促进或抑制表达及其表达量存在差异。【结论】鉴定了石仙桃中4个转录因子家族成员的数量，各家族成员主要是位于细胞核内的亲水不稳定性蛋白，并具有保守结构域特征和组织表达特异性。

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