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'永泰'杨梅亲本鉴定及其单核苷酸多态性遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈方永 1 ; 胡丹 2 ; 颜帮国 1 ; 倪海枝 1 ; 王引 1 ;

作者机构： 1.浙江省柑橘研究所

2.浙江省温州市特产站

关键词： 杨梅;亲缘关系;单核苷酸多态性标记开发;变异

期刊名称： 浙江大学学报(农业与生命科学版)

ISSN： 1008-9209

年卷期： 2020 年 46 卷 006 期

页码： 708-717

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用基因组重测序和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)系统进化树构建等方法,研究'永泰'和9个相关品种的亲缘关系,并开发了4025个SNP核心标记用于遗传和育种研究.根据SNP位点的变异性计算遗传相似系数(genetic similarity,GS),得出'永泰'与亲本'硬丝'的GS为0.99783.系统进化树构建结果表明,10个品种分为2组,其中:'黑晶''东岙早梅''乌紫''荸荠''木叶'5个品种聚为一组;'早大梅''早佳''软丝''永泰''硬丝'5个品种聚为一组,且'硬丝'与变异品种'永泰'聚为一小支.同时,'永泰'在叶片大小、叶缘、叶脉等形态学性状和果实口感上与亲本存在显著差异.通过'永泰'与参考基因组对比注释,共得到4660个单核苷酸变异位点.根据研究结果推断,'永泰'叶片和果实产生显著形态变异的原因可能是SNP位点产生了转换和颠换以及核苷酸序列发生了突变.由此可见,'永泰'既有亲本'硬丝'的基本特征,也有与其形态学和果实口感上存在的典型差异.

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