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酸柚根系CS和PEPC基因的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨林通 1 ; 林郑和 2 ; 陈立松 1 ;

作者机构: 1.福建农林大学园艺植物生理生化与分子生物学研究所

2.福建省农业科学院茶叶科学研究所

关键词: 酸柚;柠檬酸合酶;磷酸稀醇式丙酮酸羧化酶;基因克隆

期刊名称: 福建农林大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-5470

年卷期: 2012 年 41 卷 03 期

页码: 253-258

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以酸柚(Citrus grandis)根系为材料,利用热硼酸法提取了根系总RNA,并逆转录成cDNA,利用PCR和RACE技术相继得到柠檬酸合酶基因(CS)和磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(PEPC)的保守区、3'端和5'端.酸柚根系CS基因全长1760bp,开放读码框有1413 bp,编码472个氨基酸,氨基酸序列相对分子质量为52.487 ku,等电点为6.9,亲水指数为-0.199;5'端非编码区为67 bp,3'端非编码区为277 bp;推导的氨基酸经序列比对,发现与其他物种具有很高的同源性(85.4%-99.6%).酸柚根系PEPC基因全长3307 bp,开放读码框有2604 bp,编码868个氨基酸,氨基酸序列相对分子质量为99.569ku,等电点为6.68,亲水指数为-0.398;5'端非编码区为431 bp,3'端非编码区为269 bp,推导的氨基酸经序列比对,发现与其他物种具有很高的同源性(85.8%-95.7%).初步确定克隆到的为酸柚根系CS和PEPC基因,登陆Genbank,登陆号分别为HQ537481和HQ537482.

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