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斑茅过氧化氢酶基因(EaCAT-1a)克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘洋 1 ; 姚艳丽 1 ; 胡小文 1 ; 徐磊 1 ; 邢淑莲 1 ; 张树珍 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院湛江实验站/热带旱作农业研究中心

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/甘蔗研究中心

关键词： 斑茅;过氧化氢酶;基因克隆;同源进化分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2015 年 28 卷 04 期

页码： 1535-1541

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 斑茅是栽培种甘蔗最重要的近缘物种之一,具有抗逆性强等特点。本文以高粱过氧化氢酶基因(NCBI登录号为XM002437586.1)c DNA序列为探针,对甘蔗属EST数据库进行同源检索、筛选和拼接,后经基因组PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了1个斑茅过氧化氢酶基因DNA序列(Ea CAT-1a,Gen Bank登录号为KF864223)。该序列全长3831 bp,包含8个外显子和7个内含子,c DNA序列长为1532 bp,包含10 bp的5’非翻译区(UTR)和43 bp的3’UTR,以及一个1479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,此蛋白序列具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。将推测的Ea CAT-1a蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种进行同源进化分析,均表现出较高的保守性。

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