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菠萝种质目标起始密码子(SCoT)遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王健胜 1 ; 贺军虎 1 ; 陈华蕊 1 ; 陈业渊 1 ; 乔飞 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词: 菠萝种质;SCoT标记;遗传多样性

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2015 年 16 卷 04 期

页码: 848-856

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用SCo T分子标记技术对来自9个国家或地区的46份菠萝种质进行了遗传多样性分析,并对SCo T标记在菠萝研究中的效率做了探讨。结果表明,SCo T标记在菠萝种质中具有丰富的多态性,引物多态性条带百分比在75%~100%之间,平均为94.61%;引物的有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)平均值分别为1.45、0.27、0.41和0.28,表明SCo T标记具有较高的多态性检测效率。基于SCo T标记计算获得的遗传相似系数对菠萝种质做聚类分析,46份菠萝种质可被划分为5个类群,其中,第Ⅰ类群所包含的菠萝种质数量最多,占菠萝种质总数的84.78%。主成分分析获得了与聚类分析不尽一致的结论,但两者反映的种质亲缘关系基本一致。本研究结果将为我国菠萝种质的鉴定、保存和科学利用提供一定的理论依据。

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