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绥农14鼓粒期籽粒cDNA文库构建及初步分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王跃平 1 ; 李英慧 2 ; 陈雄庭 2 ; 常汝镇 2 ; 邱丽娟 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室/热带生物技术研究所

2.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室/热带生物技术研究所,中国农业科学院作物科学研究所 国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程,农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室/热带生物技术研究所,中国农业科学院作物科学研究所,国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程,农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物科学研究所,国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程,农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,,海口571101 中国农业科学院作物科学研究所,国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程,农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室北京100081,北京100081,海口571101,北京100081,北京100081

关键词： cDNA文库;表达序列标签(EST);测序;同源分析;功能注释;表达图谱

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2008 年 30 卷 01 期

页码： 40-45

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大豆EST分析对深入了解大豆重要性状形成机制并发掘新基因具有重要意义。本研究利用SMART技术,构建了绥农14鼓粒期的籽粒cDNA文库并测定EST序列,目的是分析绥农14鼓粒期的基因表达特性,为挖掘和克隆基因提供物质支撑。结果表明,本研究构建文库的初始库容为1.2×106,扩增后文库的库容为1.6×109,重组率达98%,用载体两端通用引物进行PCR鉴定,插入片段均大于0.9kb,随机对2300个单克隆测序,获得有效序列2201条,SeqMANⅡ组装整理后的序列2114条,包括1516个contig或者singlet,平均长度为672bp。对组装后的序列构建籽粒鼓粒表达图谱,发现籽粒形成初期,能量代谢、初级代谢途径、蛋白合成定向贮藏类基因表达量较多,而涉及细胞运输,细胞结构和抗性类基因表达量较低。

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