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文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

文献类型： 中文期刊

作者： 林榕燕 1 ; 钟淮钦 1 ; 黄敏玲 2 ; 罗远华 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院作物研究所福建省农业科学院花卉研究中心福建省特色花卉工程技术研究中心

2.福建省农业科学院花卉研究中心

关键词： 文心兰;EST-SSR;多态性;遗传多样性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 11 期

页码： 3113-3119

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究基于NCBI数据库中文心兰的EST序列,对其EST-SSR标记进行分析,并设计了20对EST-SSR引物用于30个文心兰品种遗传多样性性分析研究。对3 183条文心兰EST序列进行搜索,共检索出274个SSR位点,检出率为8.61%。二核苷酸重复类型是文心兰EST-SSR的主要重复类型,占60.58%。通过PCR扩增检测到13对引物有扩增产物,其中10对引物有多态性,平均每对引物扩增到10个多态性条带,各引物的多态性比率分布为75.00%~100.00%,多态性信息含量变化范围为0.69~0.93。聚类分析发现30个文心兰品种间的遗传距离变化在0.04~0.58,且在遗传距离为0.39处可将30个文心兰品种分为7大聚类群。

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