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4种大戟科植物Lhca基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邹智 1 ; 杨礼富 1 ; 安锋 1 ; 林位夫 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部儋州热带作物科学观测实验站

关键词： 大戟科植物;全基因组;Lhca基因家族;鉴定;进化分析

期刊名称： 中南林业科技大学学报

ISSN： 1673-923X

年卷期： 2014 年 10 期

页码： 56-60+75

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： LHCI是植物光系统I(PSI)中与色素分子结合的一系列膜蛋白,由Lhca基因家族编码,主要参与光能的捕获与传递。虽然Lhca基因家族已在拟南芥、水稻、杨树等模式植物中得到了系统鉴定,但在以高光效和高生物量著称的大戟科植物中,至今还未见Lhca类基因的报道。研究基于蓖麻、麻风树、木薯和橡胶树等4种大戟科植物已公布的基因组和EST数据对Lhca基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、生化特性及进化关系。结果表明,蓖麻、麻风树、木薯和橡胶树分别含有6、6、9和9个Lhca基因,分属于Lhca1、Lhca2、Lhca3、Lhca4、Lhca5和Lhca6等6个亚家族,每个亚家族含有1~2个成员不等,基因的内含子数目在2~5个之间,部分基因还存在可变剪接形式。进化分析显示,Lhca1和Lhca3亚族具有较早的起源,Lhca2和Lhca6存在于陆生生物中,Lhca4和Lhca5则只存在于高等植物中;在木薯和橡胶树中,Lhca1、Lhca2和Lhca4亚族都出现了基因的扩增。

  • 相关文献

[1]大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析. 邹智,安锋,杨礼富,王真辉,袁坤. 2013

[2]4种大戟科植物PMK基因家族的全基因组鉴定与分析. 邹智,杨礼富,安锋,林位夫,王真辉,袁坤. 2013

[3]4种大戟科植物HMGS基因家族的全基因组鉴定与分析. 邹智,谢贵水,莫业勇,安锋,杨礼富. 2014

[4]大戟科植物MVK基因家族的全基因组鉴定与分析. 邹智,杨礼富,安锋,王真辉,袁坤. 2013

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