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割手密谷胱甘肽硫转移酶基因SsGST的克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 徐磊 1 ; 胡小文 1 ; 姚艳丽 1 ; 邢淑莲 1 ; 刘洋 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院湛江实验站

关键词: 割手密;GST基因;电子克隆;RT-PCR;生物信息学

期刊名称: 广东农业科学

ISSN: 1004-874X

年卷期: 2015 年 42 卷 18 期

页码: 14-19

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为克隆割手密谷胱甘肽硫转移酶基因,采用电子克隆和RT-PCR技术获得了1个割手密GST基因,命名为Ss GST,并对其进行生物信息学分析。序列分析表明,割手密Ss GST基因c DNA全长702 bp,编码224个氨基酸,蛋白分子式为C1119H1756N300O327S5,预测蛋白质分子量为24.8 ku,等电点为6.21。蛋白疏水性分析表明Ss GST蛋白为亲水性蛋白。保守结构域预测表明Ss GST蛋白具有GST-N和GST-C结构域。Ss GST蛋白序列与玉米、高粱、谷子和甘蔗等植物的GST蛋白序列相似性较高,系统进化树分析表明,Ss GST蛋白与玉米GST蛋白亲缘关系最近。

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