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芸芥果胶酸裂解酶基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 方彦 1 ; 杨刚 2 ; 孙万仓 2 ; 武军艳 2 ; 刘自刚 2 ; 曾秀存 2 ; 李学才 2 ; 董云 3 ;

作者机构： 1.甘肃农业大学研究测试中心

2.甘肃省油菜工程技术研究中心

3.甘肃省农业科学院作物研究所

关键词： 芸芥;EsPL基因;RACE;序列分析

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2016 年 25 卷 03 期

页码： 386-395

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RACE技术从芸芥自交亲和系花药中克隆出果胶酸裂解酶(Pectate lyases,PL)基因,全长1 657bp,其完整开放阅读框(Open Read Frame,ORF)为1 371bp,编码456个氨基酸,分子质量51.179ku,等电点9.42。序列比对结果表明,该蛋白与其他植物的PL蛋白具有较高的同源性,因此命名为EsPL。进化树分析表明,芸芥EsPL基因与十字花科芸薹属植物甘蓝型油菜、白菜型油菜的PL基因亲缘关系较近。实时荧光定量PCR结果显示,EsPL在芸芥开花后自交亲和系花药中的表达量显著高于自交不亲和系花药中表达量,该基因可能在芸芥自交亲和性状调控过程中发挥重要作用。

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[2]芸芥木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶基因EsXTH1的cDNA克隆和生物信息学分析. 陈姣荣,方彦,孙万仓,令利军,姜海杨. 2013

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[6]利用RAPD分子标记技术研究芸芥(Eruca Mill.)的遗传多样性. 孙万仓,范惠玲,孟亚雄,张涛,张金文,王保成,武军艳,邵登魁,朱惠霞,燕妮,赵玉昌. 2006

[7]芸芥(Eruca.sativa Mill)总DNA提取方法及RAPD扩增体系研究. 范惠玲,孙万仓,孟亚雄. 2007

[8]我国芸芥的分布区域和品质特性及研究价值. 杨玉萍. 2001

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[10]中国芸芥遗传多样性RAPD标记分析. 孙万仓,官春云,张金文,孟亚雄,刘自刚,张涛,李栒,陈社元. 2003

[11]小麦锌指蛋白基因的克隆、序列与表达分析(英文). 万平,令利军,周文娟,张文俊,凌宏清,朱立煌,张相岐. 2004

[12]半夏凝集素基因的克隆与氨基酸序列初步分析. 张正英. 2012

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