您好，欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库！
中国热带农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

橡胶树HbWD40基因家族的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵一杰 1 ; 杜晓愚 1 ; 张世鑫 1 ; 袁红梅 1 ; 晁金泉 1 ;

作者机构： 1.海南大学热带作物学院;中国热带农业科学院橡胶研究所农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室农业农村部儋州热带作物科学观测实验站;浙江农林大学现代农学院

关键词： 橡胶树;WD40;基因家族;表达模式;亚细胞定位

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2023 年 59 卷 001 期

页码： 246-256

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WD40是一类支架蛋白,广泛参与植物的生长发育、花青素的生物合成以及生物和非生物胁迫等生命活动.利用生物信息学技术,本研究从橡胶树基因组中鉴定到258个HbWD40家族成员,并对其染色体分布、蛋白保守结构域、组织特异性表达以及低温胁迫下的表达模式进行系统分析.结果显示,HbWD40成员在18条染色体上均有分布;根据结构域的不同可将HbWD40家族划分为28个亚族;表达模式分析发现有175个成员在所有5个组织中均有表达,并鉴定到8个在低温胁迫下差异表达的成员.利用RT-PCR技术克隆了橡胶树的HbWD40-168基因.该基因CDS长1335 bp,编码444个氨基酸.保守结构域分析显示HbWD40-168含有4个WD40重复元件和2个ZnF_C3H1锌指蛋白结构域.启动子分析显示HbWD40-168启动子区域存在多种激素或胁迫相关顺式作用元件.亚细胞定位显示HbWD40-168定位于细胞核.本研究为深入鉴定HbWD40家族在橡胶树中的生物学功能提供基础.

  • 相关文献

[1]11个玉米bZIP基因应答逆境胁迫的表达分析. 贾利强,赵秋芳,陈曙. 2022

[2]油莎豆CePIP2;1的克隆、亚细胞定位与表达分析. 邹智,郑玉皎,常丽丽,赵永国. 2024

[3]油莎豆液泡膜内在蛋白基因CeTIP1;1的克隆与分析. 郑玉皎,赵永国,常丽丽,邹智. 2024

[4]油莎豆块茎表达CeTIP4;1基因的克隆、亚细胞定位及表达分析. 邹智,郑玉皎. 2024

[5]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[6]巴西橡胶树APX基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[7]橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因HbPPC1的克隆和表达分析. 王岳坤,阳江华. 2015

[8]橡胶树胞质型谷胱甘肽还原酶基因的克隆与表达分析. 邓治,刘辉,王岳坤,李德军. 2014

[9]橡胶树乙醇酸氧化酶蛋白理化特性及基因表达模式分析. 龙翔宇,卢基来,方永军,秦云霞. 2019

[10]巴西橡胶树伤害诱导蛋白基因的克隆及表达分析. 刘向红,邓治,李德军. 2012

[11]橡胶树水通道蛋白HbPIP2;7的亚细胞定位与多聚化分析. 邹智,郑玉皎,乔雪莹,阳江华. 2024

[12]橡胶树水通道蛋白HbPIP1;4的亚细胞定位与多聚化分析. 邹智,郑玉皎,乔雪莹. 2024

[13]橡胶树HbPIP1;1基因的克隆及蛋白的亚细胞定位与多聚化分析. 乔雪莹,郑玉皎,阳江华,曾长英,邹智. 2022

[14]橡胶树胶乳HbHSP90.6基因克隆、表达与亚细胞定位分析. 刘明洋,杨洪,代龙军,王立丰,郭冰冰. 2023

[15]橡胶树HbEBP1蛋白亚细胞定位初步研究. 祝建顺,程汉,肖成江,安泽伟,黄华孙. 2013

[16]植物肉桂醇脱氢酶及其基因研究进展. 张鲁斌,谷会,弓德强,常金梅. 2011

[17]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019

[18]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022

[19]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023

[20]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国热带农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台