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橡胶树HbWD40基因家族的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵一杰 1 ; 杜晓愚 1 ; 张世鑫 1 ; 袁红梅 1 ; 晁金泉 1 ;

作者机构： 1.海南大学热带作物学院;中国热带农业科学院橡胶研究所农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室农业农村部儋州热带作物科学观测实验站;浙江农林大学现代农学院

关键词： 橡胶树;WD40;基因家族;表达模式;亚细胞定位

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2023 年 59 卷 001 期

页码： 246-256

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WD40是一类支架蛋白,广泛参与植物的生长发育、花青素的生物合成以及生物和非生物胁迫等生命活动.利用生物信息学技术,本研究从橡胶树基因组中鉴定到258个HbWD40家族成员,并对其染色体分布、蛋白保守结构域、组织特异性表达以及低温胁迫下的表达模式进行系统分析.结果显示,HbWD40成员在18条染色体上均有分布;根据结构域的不同可将HbWD40家族划分为28个亚族;表达模式分析发现有175个成员在所有5个组织中均有表达,并鉴定到8个在低温胁迫下差异表达的成员.利用RT-PCR技术克隆了橡胶树的HbWD40-168基因.该基因CDS长1335 bp,编码444个氨基酸.保守结构域分析显示HbWD40-168含有4个WD40重复元件和2个ZnF_C3H1锌指蛋白结构域.启动子分析显示HbWD40-168启动子区域存在多种激素或胁迫相关顺式作用元件.亚细胞定位显示HbWD40-168定位于细胞核.本研究为深入鉴定HbWD40家族在橡胶树中的生物学功能提供基础.

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