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海南本地抗病小米辣响应象耳豆根结线虫侵染的miRNA鉴定及其靶基因预测

文献类型: 中文期刊

作者: 高畅 1 ; 张志远 2 ; 刘子记 3 ; 陈梅红 4 ; 朱婕 1 ; 曹振木 3 ;

作者机构: 1.海南大学热带农林学院(农业农村学院

2.浙江大学海南研究院

3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

4.海南缤纷园艺有限公司

关键词: 灌木辣椒;抗象耳豆根结线虫;sRNA测序;miRNA;靶基因

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2025 年 46 卷 007 期

页码: 1571-1583

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 象耳豆根结线虫(Meloidogyneenterolobii)是一种对辣椒生产危害较大的病原物,使用抗病品种是防治该病害最为经济、环保的手段。深入理解根结线虫抗性调控机理将有利于加速抗病育种进程。本课题组前期研究中对海南本地抗病小米辣种质CF25进行了接种前后的转录组数据分析,挖掘了与根结线虫抗性相关的代谢通路。为进一步探索抗性表达调控机理,本研究对CF25接种前后sRNA文库进行了高通量测序,共检测到133个差异表达miRNAs。以P≤0.05和|log2(FC)|≥3为筛选标准,鉴定出33个显著差异表达的miRNAs,其中包括19个已知miRNAs和14个新发现miRNAs。对33个显著差异表达的miRNAs进行靶基因预测,共得到373个靶基因,其中miR5658-z预测靶基因数量最多。GO功能和KEGG代谢通路富集分析显示靶基因主要富集于植物-病原菌互作、信号转导等通路,推测miRNA介导的信号转导及植物防御反应可能是CF25抗象耳豆根结线虫的重要原因。为初步验证差异表达miRNA和靶基因间的调控关系,选取6个差异表达miRNAs及其靶基因进行qRT-PCR表达验证,得出miRNA与靶基因的表达差异趋势与高通量测序结果一致,基本符合miRNA负向调控靶基因表达的规律。以上研究结果表明miRNA可能在辣椒对根结线虫的防御反应中起到了重要作用,为后续深入解析miRNA介导的根结线虫抗性机理奠定基础。

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