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基于ISSR和ITS分子标记的海南砂仁种质资源遗传多样性评价

文献类型: 中文期刊

作者: 罗 凡 1 ; 瞿 云苹 1 ; 陈 振夏 2 ; 杨 涛 1 ; 范 宇光 1 ; 潘 坤 3 ;

作者机构: 1.海南医科大学药学院

2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

3.海南医科大学药学院/海南省中药原料监测与技术服务中心

关键词: 海南砂仁;遗传多样性;遗传分化;ISSR;ITS;单倍型

期刊名称:

ISSN: 1000-8551

年卷期: 2025 年 39 卷 5 期

页码: 886-896

摘要: 为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,ISSR引物筛选共获得25条多态性较高的引物,扩增获得132个位点,其中多态性位点93个,多态性比率达70.45%。通过对观测到的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、居群内Nei’s基因多样性(H)、Shannon多样性信息指数(I)和基因流(Nm)统计,其平均值分别为1.164、1.103、0.059、0.087和0.271。基于海南砂ITS序列比对信息,检测出了11个单倍型,但在不同的居群中这些单倍型的分布不均匀,多个居群中仅检测出一种单倍型。上述结果表明,居群内的遗传多样性较低,不同地理居群的海南砂基因交流较少、遗传分化明显,居群间的遗传变异是其总遗传多样性的来源,由于居群间基因交流匮乏,已经导致海南砂居群内出现近交衰退。本研究可为海南砂种质资源的保护、利用和可持续开发提供科学依据。

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