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菠萝PEPC基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马海洋 1 ; 赵秋芳 1 ; 陈曙 1 ; 石伟琦 1 ; 冼皑敏 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;海南省热带作物营养重点实验室;农业农村部热带果树生物学重点实验室

关键词： 菠萝;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC);基因进化;基因表达谱

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 97-103

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPC)在C_4和景天酸代谢(CAM)光合途径吸收CO_2过程中发挥重要作用,并参与各种非光合作用过程,包括果实成熟、气孔开放、碳氮相互作用、种子形成和萌发以及调节植物对逆境胁迫的耐受性。菠萝为典型的景天酸代谢途径(CAM)植物,为了解磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)在菠萝景天酸代谢途径(CAM)中的作用,本研究鉴定到3个菠萝PEPC基因,按照基因描述命名为AcPEPC1、AcPEPC3和AcPEPC4,进化树分析结果 AcPEPC1和AcPEPC3为植物型PEPC(PTPCs)蛋白,序列同源性较高且基因结构、保守结构域及保守基序均一致。AcPEPC4为细菌型PEPC(BTPCs)蛋白,与AcPEPC1/AcPEPC3间的序列同源性低。组织表达分析表明AcPEPC1菠萝叶片表达量较高,而AcPEPC3和AcPEPC4在菠萝花和果实表达量较高。

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