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植物烯酰辅酶A还原酶家族的基因鉴定和分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王鹏 1 ; 淮东欣 ; 盖江涛 1 ; 李慧;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 植物烯酰辅酶A还原酶;超长链脂肪酸;结构域;进化

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 36 卷 10 期

页码： 4275-4281

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物烯酰辅酶A还原酶(ECR)是超长链脂肪酸合成的最后一步关键酶。植物中,针对ECR的基因多集中于拟南芥,而鲜有其它植物中ECR基因鉴定的报道,更没有针对其基因全面鉴定及家族进化的报道。本研究首先从拟南芥ECR蛋白序列中鉴定得到了编号为PF02544.12的结构域,进而从8种从藻类到被子植物的基因组中鉴定得到了48条ECR家族成员。进化树构建结果表明,此家族基因可进一步细分为4个亚家族,其中3个亚家族中的拟南芥基因均得以阐明,分别为ECR、PPRD和DET2基因;这3个亚家族成员在从藻类到高等植物的各基因组中均存在,且ECR和PPRD的数目在被子植物中极为保守,表明其在植物中发挥重要且根本的功能。第4个亚家族仅在陆地植物中存在,且基因拷贝数在各陆地物种中极为保守,暗示其在陆地植物中起重要作用。ECR和PPRD基因编码蛋白较大,而各基因疏水性较高,且不稳定系数较高。本研究为进一步全面阐明植物中ECR基因的功能提供了基础。

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