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低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价

文献类型: 中文期刊

作者: 林珲 1 ; 裘波音 1 ; 朱海生 1 ; 温庆放 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院作物研究所/福建省蔬菜遗传育种重点实验室/福建省蔬菜工程技术研究中心

关键词: 茄子;内参基因;实时荧光定量PCR;标准化;基因表达

期刊名称: 福建农业科技

ISSN: 0253-2301

年卷期: 2024 年 55 卷 008 期

页码: 1-15

摘要: 为了探索茄子Solanum melongena L.的基因表达模式,利用qRT-PCR方法分析了茄子ACT、EF1α、TUA、TUB、GAPDH、eIF、UBQ、UBI3、PP2A、CYP、RPL28、L25、SAND、TBP、DNAJ、APRT、EXP、CAC、HSP20和CysPro 20个候选内参基因mRNA的表达差异情况,并运用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3种计算方法评价茄子20个候选内参基因在低温、弱光、低温弱光叶片样品中的表达稳定性。结果表明:茄子20个候选内参基因荧光定量引物扩增效率(E)数值在96.8%~117.6%,相关系数(R2)介于0.968 8~0.999 9,扩增效率良好,扩增反应具有高度的专一性,引物能特异性扩增,特异性好,均为单峰,样品间扩增曲线重复性强,可用于qRT-PCR扩增。茄子20个候选内参基因CT值表达丰度分析,发现茄子20个候选内参基因平均CT值在19.76~31.20。3种计算方法的综合评价分析结果显示,TBP基因在所有样本中为最稳定的内参基因。研究可为茄子低温、弱光和低温弱光胁迫下基因特异性表达研究提供了合适的内参基因。

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