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亚麻EST序列中SSR标记的筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 张建平 1 ; 王斌 2 ; 赵丽娟 1 ; 王利民 1 ; 杨崇庆 2 ; 颉瑞霞 2 ; 党占海 1 ;

作者机构： 1.甘肃省农业科学院

2.甘肃农业大学

关键词： 亚麻;EST;SSR;标记

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2009 年 29 卷 05 期

页码： 58-63

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用亚麻NCBI数据库中的7941条亚麻EST序列进行SSR的筛选,共发现222个SSR,占整个EST数据库的2.73%,其中三核苷酸重复单元的EST-SSR占总SSR的72.1%,二核苷酸和四核苷酸二者出现的频率基本相近,分别占总SSR的14.4%和13.5%.AGAA是四核苷酸中的优势重复类型,占四核苷酸重复类型的67.67%.设计的21对EST-SSR引物中有18对在10个亚麻材料中有扩增产物,占设计引物的85%,有14对产物条带比较清晰并具有多态性.基于SSR标记进行聚类分析,可将10个亚麻材料划分为3个组.本研究建立的亚麻SSR标记,为亚麻遗传多样性鉴定、分子作图等研究提供了一种有效的分子标记系统.

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[2]绿豆高密度分子遗传图谱的构建. 吴传书,王丽侠,王素华,陈红霖,吴健新,程须珍,杨晓明. 2014

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