文献类型： 中文期刊
作者： 田丽波 1 ; 谷幸幸 1 ; 商桑 1 ; 杨衍 2 ;
作者机构： 1.海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点试验室
2.中国热带农业科学院作物品种资源研究所
关键词： 苦瓜;基因组DNA;提取方法;ISSR;优化体系
期刊名称： 中国农学通报
ISSN： 1000-6850
年卷期： 2013 年 29 卷 04 期
页码： 88-93
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了快速获取高质量的苦瓜基因组DNA,以便进行苦瓜白粉病抗性基因分子标记研究,比较了不同的DNA提取方法、不同部位的苦瓜叶片提取基因组DNA的产量和质量,探究了苦瓜基因组DNA提取的最佳方法和叶片的最适部位;研究了ISSR-PCR的退火温度,并采用正交设计法对影响ISSR-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq酶、模板DNA以及引物浓度等5个因素进行了优化。结果表明,采用改良CTAB法从苦瓜顶端嫩叶中提取的基因组DNAOD260/OD280值在1.8～1.9之间,OD260/OD230值为2.0左右,对DNA样品进行琼脂糖凝胶电泳检测,主带清晰,降解较少,产量和纯度均较高,效果较好。优化后的ISSR-PCR反应体系为:2.5μL10×PCRbuffer,2.5mmol/LMgCl2,250μmol/LdNTPs,10ng模板DNA,0.75UTaq酶,引物浓度0.7μmol/L,反应总体积为25μL,引物UBC826最佳退火温度为53℃。该体系在多次重复中均能获得良好的扩增结果。苦瓜基因组DNA提取的最佳方法为改良CTAB法,最适合的部位为顶端嫩叶。
- 相关文献
[1]橡胶白粉菌(Oidium heveae Steinmann)基因组DNA的提取方法. 高宏华,刘先宝,罗大全,黄贵修. 2007
[2]香蕉枯萎菌基因组DNA提取方法的研究. 漆艳香,谢艺贤,张欣,张辉强. 2004
[3]SDS法提取石斛基因组DNA的研究. 李静,尹俊梅,任羽,杨光穗. 2009
[4]几种橡胶基因组DNA提取方法的比较. 尹一伊,王玲,廖文彬,彭明. 2010
[5]农杆菌介导的香蕉枯萎病菌4号生理小种转化体系的优化. 高剑,肖苏生,王文华,曾涛,曾会才. 2009
[6]Genetic diversity analysis among and within populations of Pogostemon cablin from China with ISSR and SRAP markers. Wu, You-Gen,Guo, Qiao-Sheng,Wu, You-Gen,Lin, You-Fen,Luo, Li-Juan,Wu, You-Gen,He, Ji-Chan,Liu, Guo-Dao. 2010
[7]Genetic relationships of Cynodon arcuatus from different regions of China revealed by ISSR and SRAP markers. Huang, Chunqiong,Liu, Guodao,Bai, Changjun,Wang, Wenqiang.
[8]三种天然橡胶树DNA提取方法的比较研究. 黄炎,郭庆水,徐立新,陈守才. 2008
[9]药用植物艾纳香基因组DNA提取方法研究. 庞玉新,王文全,张影波,刘国道,莫廷辉. 2009
[10]荔枝基因组DNA的提取. 李明芳,郑学勤. 2004
[11]双条拂粉蚧基因组DNA提取方法的比较和优化. 王宇航,孟秀利,黄山春,林兆威,宋薇薇,唐庆华,覃伟权. 2023
[12]SDSC-TAB和高盐沉淀法提取香蕉枯萎病菌基因组DNA的比较. 漆艳香,谢艺贤,张欣,张辉强. 2005
[13]一种提取橡胶树叶中总DNA的方法. 安泽伟,黄华. 2005
[14]利用改良CTAB法提取木薯基因组DNA. 闫庆祥,黄东益,李开绵,叶剑秋. 2010
[15]槟榔基因组DNA的高效提取方法. 曾莉娟,李涛,张雨良,刘志昕. 2010
[16]改良CTAB法提取益智基因组DNA. 刘晓静,王海燕,张根良,夏志强,王文泉. 2007
[17]橡胶树AFLP银染体系的建立和优化. 王惠君,和丽岗,夏志强,王海燕,付瑜华,卢诚,王文泉. 2007
[18]山蚂蝗属植物DNA提取方法研究. 王春梅,徐娜,李阳春,白昌军,徐立. 2011
[19]山蛭基因组DNA的提取及其PCR扩增产物的分析. 谭琳,康由发,施江,郑学勤. 2003
[20]油棕基因组DNA 3种提取方法的比较研究. 周丽霞,肖勇,杨耀东,马子龙. 2013
作者其他论文 更多>>
-
苦瓜苗期耐冷性的多世代联合遗传分析
作者：牛玉;于仁波;韩旭;刘昭华;杨衍
关键词：苦瓜;苗期;耐冷;遗传分析
-
绿色樱桃番茄果实挥发性风味物质分析
作者：刘子记;刘维侠;牛玉;杨衍
关键词：绿色樱桃番茄;顶空固相微萃取;气相色谱-质谱联用;挥发性物质
-
腐植酸型功能肥料对酸化土壤改良和香蕉生长的作用
作者：苏初连;邓爱妮;范琼;罗金辉;冯剑;杨衍;赵敏
关键词：腐殖酸型功能肥料;科学施肥;土壤改良;根系生长
-
苦瓜嫁接砧木对象耳豆根结线虫的抗性鉴定
作者：李荣兰;牛玉;田丽波;杨衍;刘子记
关键词：苦瓜砧木;象耳豆根结线虫;抗性鉴定;隶属函数;聚类分析
-
木薯转录因子MeERF117的克隆及表达分析
作者：林世扬;颜彦;田丽波;商桑;胡伟
关键词：木薯;ERF转录因子;采后生理性变质;表达分析
-
苦瓜种质资源枯萎病抗性评价
作者：王艳茹;杨衍;牛玉;田丽波;刘子记
关键词：苦瓜;种质资源;枯萎病;抗病性鉴定
-
1-甲基环丙烯处理对樱桃番茄果实低温贮藏品质的影响
作者：弓德强;李敏;高兆银;杨衍;姚全胜;胡美姣
关键词：1-甲基环丙烯;樱桃番茄;低温;品质
