您好,欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库!

香蕉枯萎病菌GATA转录因子基因Fnr1的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 漆艳香 1 ; 张欣 1 ; 张贺 1 ; 陆英 1 ; 蒲金基 1 ; 喻群芳 1 ; 谢艺贤 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所·农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点开放实验室·海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室

关键词: 香蕉枯萎病;尖孢镰刀菌古巴专化型;GATA转录因子;Fnr1;克隆;序列分析

期刊名称: 果树学报

ISSN: 1009-9980

年卷期: 2014 年 04 期

页码: 689-696

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】明确香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)2个生理小种(Foc1和Foc4)GATA转录因子基因(Fnr1)的序列差异,为进一步研究Fnr1在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用奠定基础。【方法】根据番茄枯萎病菌2号生理小种(F.oxysporum f.sp.lycopersici race 2)和水稻恶苗病菌(Gibberella fujikuroi)的GATA转录因子的氨基酸序列设计引物,利用重叠延伸PCR和RT-PCR技术分别克隆了香蕉枯萎病菌2个生理小种的Fnr1的全长DAN,并对该基因所编码蛋白进行了氨基酸序列特征、系统发育与保守结构域分析。【结果】2个生理小种的Fnr1(分别命名为F1nr1和F4nr1)DNA片段全长分别为2 967 bp和2 958 bp,开放阅读框架分别为2 727 bp和2 718 bp,分别编码908个和905个氨基酸。F1nr1和F4nr1的预测氨基酸序列相似性为99%,与GenBank中公布的Fusarium spp.GATA转录因子氨基酸序列均有88%~99%相似性。氨基酸序列聚类分析显示,F1nr1和F4nr1与GenBank中已登陆的香蕉枯萎病菌1号生理小种(F.oxysporum f.sp.cubense race 1,Foc1)、尖孢镰刀菌(F.oxysporum)和番茄尖孢镰刀菌2号生理小种(F.oxysporum f.sp.lycopersici race 2)等物种的GATA转录因子蛋白高度同源。蛋白质保守域搜索表明,F1nr1和F4nr1具有GATA结合蛋白的功能域,属于GATA结合蛋白家族的一员。【结论】香蕉枯萎病菌Fnr1基因具备GATA构型转录因子家族的序列特征,推测该基因可能参与调控F.oxysporum f.sp.cubense氮调控相关基因的表达及致病性等。

  • 相关文献

[1]不同抗性香蕉品种根系分泌差异酚酸对尖孢镰刀菌的抑制. 翟子翔,李得铭,邓涛,邓大豪,杨腊英,周游,郭立佳,黄俊生. 2020

[2]FoAP1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的功能分析. 齐兴柱,杨腊英,郭立佳,黄俊生. 2013

[3]香蕉枯萎病生防微生物产品的功效限制因子. 郭刚,曾会才,刘兵团,汪腾. 2010

[4]3种测定香蕉枯萎病病菌致病力方法的比较. 杨腊英,郭立佳,毛超,刘磊,梁昌聪,陈平亚,王国芬,黄俊生. 2015

[5]巴西蕉诱导的香蕉枯萎病菌1号和4号小种致病相关基因表达分析. 肖义炜,李春强,李文彬,孙建波,曾会才,彭明. 2015

[6]香蕉枯萎病菌分子检测研究进展. 杨迪,杜婵娟,叶云峰,彭军,张欣,付岗. 2020

[7]尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种红色荧光蛋白基因转化. 谢德啸,羊玉花,周端咏,郭立佳,彭军,黄小娟,齐兴柱,黄俊生. 2012

[8]橡胶树茉莉酸生物合成关键酶AOS基因启动子的克隆及序列分析. 段翠芳,曾日中,黎瑜,魏小弟. 2006

[9]黑曲霉G-1125生淀粉糖化酶基因的克隆与序列分析. 孙海彦,黎娟华,刘恩世,易小平,杨景豪,尹一伊,彭明. 2015

[10]海南黑山羊鞭虫rDNA-ITS片段的克隆及序列分析. 荣光,周汉林,侯冠彧,王东劲,赵军明. 2010

[11]新牧一号杂花苜蓿MvNHX1基因的表达分析和提高烟草耐盐性的研究. 张桦,张富春,张雨良,张博,陈全家. 2011

[12]拟南芥LFY CDNA的克隆及转化菊花的研究. 邵寒霜,李继红,郑学勤,陈守才. 1999

[13]拟南芥Lfy基因的克隆及全序列分析. 邵寒霜,李继红,郑学勤,陈守才. 1998

[14]长春花小叶病植原体质粒DNA克隆及其分子特征. 郑文虎,车海彦,符瑞益,杨毅,罗大全. 2012

[15]香蕉钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白基因MaCBL1的克隆及序列分析. 李美英,徐碧玉,杨小亮,刘菊华,张建斌,金志强. 2008

[16]五指山小型猪PDCD10 cDNA的克隆及生物信息学分析. 杜丽,荣辉,张珈宁,侯冠彧,周汉林,郭莳雨,贾晓哓,史巧芸,王凤阳. 2013

[17]杧果炭疽病菌漆酶基因lac1的克隆与序列特征分析. 韦运谢,刘晓妹,张贺,张欣,漆艳香. 2013

[18]香蕉MaARF2基因的克隆及序列表达分析. 黄东梅,许奕,吴斌,马伏宁,陈弟,李敬阳,林妃,宋顺. 2020

[19]海南山蛭蛭素基因的克隆和序列分析. 谭琳,康由发,谭恩光,郑学勤. 2004

[20]海南仙人掌matK基因的克隆和序列分析. 吴育鹏,余乃通,周启林,王健华,刘志昕. 2016

作者其他论文 更多>>