文献类型： 中文期刊
作者： 杜洋 1 ; 张智韦 2 ; 陆爽 1 ; 刘雪 3 ; 李大勇 3 ; 徐朝阳 3 ; 王晨晨 3 ; 张彬 3 ; 许立新 1 ;
作者机构： 1.北京林业大学草业与草原学院
2.中煤科工生态环境科技股份有限公司
3.北京市农林科学院蔬菜所
关键词： TCP基因家族;菊苣;表达分析;家族分析
期刊名称： 草地学报
ISSN： 1007-0435
年卷期： 2024 年 32 卷 008 期
页码： 2428-2439
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： TCP转录因子参与调控植物多种生理过程，包括植物叶片发育、花发育、分枝的形成等方面。菊苣(Cichorium intybus L.)是一种优良牧草，但目前还未有关于其TCP基因家族研究的报道。本研究基于菊苣全基因组数据，利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)、生菜(Lactuca sativa L.)TCP基因家族的氨基酸序列，对菊苣TCP基因家族成员进行鉴定筛选，最终得到39个菊苣TCP基因家族成员。接着利用生物信息学方法对这些成员进行分析发现，39个成员不均匀分布在9条染色体上；氨基酸数目为113～498,分子量为12 425.84～56 266.57Da;所有成员分为3个亚家族；均含有保守的basic-helix-loop-helix(bHLH)结构域；顺式作用元件分析发现，菊苣TCP家族成员具有多种激素、非生物胁迫和生长发育响应元件；对CIN类TCP基因在菊苣各组织和高温胁迫下进行表达分析发现，这些成员可能参与菊苣的叶片发育调控且对高温胁迫响应。本研究可以为改良菊苣牧草品质提供理论依据。
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