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香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 王卓 1 ; 殷晓敏 2 ; 王家保 3 ; 徐碧玉 4 ; 金志强 5 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院海口实验站

2.海南大学

3.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

4.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

5.农业部热带生物技术重点开放实验室

关键词： 香蕉;根系;均一化;cDNA文库;基因;表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2011 年 38 卷 09 期

页码： 1667-1674

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以香蕉幼苗根系为材料,利用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanismat5′end of RNA transcript)技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cDNA文库。经检测,初级文库滴度1.1×106cfu·mL-1,库容5×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1kb,表明文库质量较好。随机挑取192个克隆进行EST(expressed sequencetags)测序,成功获得179个高质量EST,含5个conting和174个singlet,冗余度仅为2.35%。小规模测序拼接后获得145个unigenes,对unigenes分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选3个与其它植物同源的抗逆基因,利用RT-PCR方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这3个基因在不同的逆境下差异表达。

  • 相关文献

[1]枯萎病菌诱导香蕉根的均一化全长cDNA文库构建及防御基因的表达模式分析. 王尉,胡玉林,莫亿伟,孙德权,谢江辉. 2011

[2]香蕉延长因子1A(MaEF1A)基因的分离及特征分析. 刘菊华,徐碧玉,陈敦忠,张静,张建斌,贾彩红,金志强. 2011

[3]香蕉果实cDNA文库的构建. 金志强,康由发,彭世清,孔德謇,郑学勤. 1999

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[5]香蕉根系转录组SSR位点信息分析. 王静毅,刘菊华,王卓,金志强,徐碧玉. 2019

[6]根际pH值对香蕉幼苗生物量和根系生长的影响. 王丽霞,刘永霞,丁哲利,井涛,王必尊,何应对. 2024

[7]香蕉泛素结合酶基因与果实成熟关系的研究. 王园,王甲水,谢学立,雷晓明,金志强. 2010

[8]橡胶延长因子基因的原核表达及其多克隆抗体的制备. 陈章权,吴坤鑫,梁晓东,黄震,陆田田. 2008

[9]巴西橡胶树两个蔗糖合成酶基因的克隆和表达分析. 朱家红,徐靖,畅文军,张治礼. 2014

[10]荔枝漆酶基因LcLac的克隆与表达分析. 刘保华,肖茜,冯超,孙进华,王家保. 2012

[11]植物体细胞胚发生过程中基因表达的研究进展. 陈洁,王颖,李辉亮,彭世清. 2008

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[14]香蕉凝集素基因的克隆及在成熟果实中的特异性表达(英文). 金志强,张德有,徐碧玉. 2004

[15]香蕉胁迫相关蛋白基因的克隆及其表达分析. 徐碧玉,王卓,贾彩红,刘菊华,金志强. 2014

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[17]香蕉(‘威廉斯突变体’)苯丙氨酸解氨酶基因克隆、表达及酶活性分析(英文). 王尉,胡玉林,谢江辉. 2009

[18]香蕉水通道蛋白基因的克隆与表达分析. 谢学立,刘菊华,徐碧玉,金志强. 2008

[19]橡胶树胶乳均一化全长cDNA文库的构建与EST测序分析. 曾日中,段翠芳,聂智毅,代龙军,黎瑜. 2011

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