您好，欢迎访问浙江省农业科学院 机构知识库！
浙江省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

黄麻(Corchorus capsularis L.)干旱胁迫转录组初步分析

文献类型： 中文期刊

作者： 金关荣 1 ; 陈杰 2 ; 安霞 1 ;

作者机构： 1.浙江省萧山棉麻研究所浙江省农业科学院花卉研究开发中心

2.华中农业大学生命科学技术学院

关键词： 黄麻(Corchorus spp.);干旱胁迫;转录组;转录因子;简单序列重复

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2020 年 023 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 黄麻(Corchorus spp.)是重要的纤维作物,全球种植面积仅次于棉花.在当前全球变暖和气候异常的趋势下,干旱对于作物减产的负面影响尤其凸显.因此,研究黄麻响应干旱胁迫的分子机理对于缓解该矛盾具有重要的作用.本研究采用二代测序技术,对干旱胁迫处理下的黄麻幼苗植株进行转录组测序,通过对原始测序数据进行质量控制,并利用Trinity和Corset等软件进行序列拼接,得到了高质量的测序和拼接结果.随后对拼接得到的基因进行功能注释和相关分析,共得到23 297条非冗余基因,其中包含386条编码分属于46个转录因子家族的基因.对基因序列进行简单序列重复(simple sequence repeat, SSR)分析,获得了所有非冗余基因以及转录因子对应的SSR信息.相关结果为后续针对黄麻响应干旱胁迫的相关研究提供了候选分子资源.

  • 相关文献

[1]低温胁迫下枇杷不同发育阶段的花果转录组比较分析. 徐红霞,周慧芬,李晓颖,姜路花,陈俊伟. 2021

[2]秋茄低温胁迫转录组分析及脱落酸信号途径基因挖掘. 郭晋敏,杨升,刘星,王金旺,王文卿,陈秋夏. 2023

[3]洋桔梗(Eustoma grandiflorum)干旱胁迫转录组初步分析. 安霞,朱强,楼旭平,李鲁峰,陈杰,柳婷婷,李文略,骆霞虹,朱关林,余利隽. 2022

[4]模拟干旱胁迫下大豆耐旱突变体的生理和转录组分析. 曹颖,竹龙鸣,邓平,陈紫芸,袁凤杰. 2024

[5]锌指蛋白转录因子Di19参与调控大豆干旱响应的研究进展. 张古文,沈立,郑华章,刘娜,冯志娟,龚亚明. 2020

[6]药用植物中GRAS转录因子的功能研究进展. 刘云辉,李珅,王洋,羊健,周伟,沈亚芳. 2019

[7]萝卜(Raphanus sativus)Dof基因家族全基因组鉴定分析. 赵国富,魏庆镇,汪精磊,包崇来. 2019

[8]含抗草甘膦CP4-EPSPS基因和耐逆Trihelix类转录因子GmGT-2A基因的植物表达载体构建及转化验证. 李雁杰,朱丹华,冯小锋,高莎,杨清华,董德坤. 2015

[9]水稻耐铝毒机制研究进展. 葛敏,王华,陶跃之. 2010

[10]草莓花青苷分子调控机理的初步研究. 苗立祥,荣宁宁,张豫超,杨肖芳,张琴,蒋桂华. 2015

[11]大豆抗旱相关转录因子研究进展. 李雁杰,朱丹华,董德坤. 2014

[12]牡丹PsDREB转录因子基因的克隆及亚细胞定位. 刘慧春,马广莹,朱开元,邹清成,周江华,张加强. 2015

[13]PHD类转录因子GmPHD2和Bar基因的植物表达载体的构建. 马晓丽,朱丹华,李雁杰,杨清华,董德坤. 2013

[14]WRKY转录因子超家族的研究. 郝中娜,陶荣祥. 2006

[15]茄果类蔬菜MYB转录因子研究进展. 艾佳琦,庞鸿涛,胡天华,包崇来,魏庆镇. 2023

[16]Os WRKY80基因参与调控水稻抗病反应研究. 李南羿,柴荣耀,郭泽建. 2009

[17]转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用. 李小白,向林,罗洁,胡标林,田胜平,谢鸣,孙崇波. 2013

[18]鸭不同羽色毛囊组织差异表达基因转录组测序分析. 蒋兵兵,黄曼曼,白天,曾涛,陈黎,沈军达,陶争荣,周玮,刘国发,卢立志,李海英. 2020

[19]有翅型和无翅型小麦禾谷缢管蚜转录组差异分析. 鲁艳辉,虞飞博,郭嘉雯,田俊策,郑许松,吕仲贤. 2021

[20]转录组分析揭示热激诱导家蚕孤雌生殖发生相关的信号通路. 陈金娥,杜鑫,徐霞,于少芳,姚陆松,何秀玲,王永强. 2022

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：浙江省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台