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尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中FoGAS1基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈平亚 1 ; 毛超 2 ; 杨腊英 3 ; 黄俊生 3 ;

作者机构： 1.海南大学环境与植物保护学院

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业部热带农林有害生物入侵检测与控制重点实验室海南省热带农业有害生物检测与控制重点实验室

3.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

关键词： FOC4;GAS1;生物信息学分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2014 年 33 卷 04 期

页码： 89-94

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR和RT-PCR的方法,从尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中克隆得到了FoGAS1基因的DNA及cDNA序列,并运用生物信息学的方法对该基因所编码的氨基酸序列进行分析,预测其编码蛋白质的结构和功能。结果表明,FoGAS1基因全长1 672 bp,其中开放阅读框全长1 623 bp,编码含有540个氨基酸残基的蛋白质,该蛋白分子量为58398.1,等电点pI=4.83,为性质稳定的亲水性蛋白。FoGAS1蛋白为跨膜蛋白,含有22个丝氨酸磷酸化位点,2个苏氨酸磷酸化位点,8个酪氨酸磷酸化位点。该蛋白在C端有一个信号肽结构,为一种分泌蛋白。通过系统进化树分析,该蛋白在不同种属镰刀菌中高度保守。

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