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南方根结线虫延长因子2基因cDNA全长克隆和序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黎娟华 1 ; 赵平娟 1 ; 孙海彦 1 ; 彭明 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 南方根结线虫;延长因子2;RACE;蛋白功能预测

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2011 年 27 卷 01 期

页码： 223-228

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以南方根结线虫为材料,根据同源序列法分别进行3'末端和5'末端的RACE,获得延长因子基因2cDNA全长。此cDNA全长序列为2434bp,包括2334bp的完整ORF,编码一含777个氨基酸的多肽。该基因命名为Mi-eft2,其推导蛋白MI-EFT2的编码氨基酸与秀丽隐杆线虫的Ce-eft1,Ce-eft2,Ce-eft3,Ce-eft4基因的推导蛋白的同源性分别为26.7%、86.9%、13.8%和8.9%。蛋白功能分类预测MI-EFT2是一种在蛋白质延长过程中起作用的GTP水解酶,与真核生物的延长因子2功能相同。

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