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高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐志军 1 ; 刘洋 2 ; 徐磊 2 ; 安东升 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院

2.中国热带农业科学院 湛江实验站

关键词： 高粱;STP;基因家族;系统进化;表达分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2019 年 005 期

页码： 65-73

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 糖转运蛋白(Sugar transporter protein,STP)基因家族在植物单糖分配中具有重要作用,并参与植物生长和发育过程中的许多代谢进程.为探究STP基因家族在高粱生长发育中的潜在功能,对高粱STP基因家族进行了全基因组鉴定、分类和组织表达分析.从高粱基因组中共鉴定出19个包含Sugar_tr结构域的STP基因,不均匀分布于9条染色体上,其中有4个基因位于基因组重复区.19个SbSTP根据其系统发育特征可以分为5组,同组的家族成员具有相同或类似的基序类型和排列顺序,但在内含子和外显子数量上存在较大差异.RNA-Seq数据分析显示,至少有18个SbSTP基因可以表达,不同的基因在不同的组织中具有不同的表达模式,其中SbSTP11特异性在花中表达,SbSTP4、SbSTP5在特定组织中受ABA和PEG的诱导表达.为进一步研究单个SbSTP基因的生物学功能,挖掘SbSTP家族的应用潜力奠定了基础.

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