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巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 肖小虎 1 ; 隋金蕾 1 ; 戚继艳 1 ; 秦云霞 1 ; 黄亚成 1 ; 唐朝荣 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所

关键词： 巴西橡胶树;CCaMK;基因家族;结构与进化;表达分析

期刊名称： 热带农业科学

ISSN： 1009-2196

年卷期： 2016 年 36 卷 12 期

页码： 16-20

摘要： 钙/钙调素依赖型蛋白激酶(CCa MK,calcium-and calmodulin-dependent protein kinase)是一种钙离子结合蛋白,在钙信号传导过程中起重要作用。本研究以已发表的CCa MK序列作为检索序列,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的基因组和转录组数据进行全面搜索,鉴定得到6个CCa MK基因,其中包括一个橡胶树CCa MK基因,命名为Hb CCa MK1。序列分析发现:5种植物的CCa MK氨基酸序列同源性较高,为73%~94%。基因结构分析发现,Hb CCa MK1和所分析的其他植物CCa MK一样均,含有6个内含子、1个蛋白激酶结构域和3个EF-hand结构域;从结构和进化上看,Hb CCa MK1和蓖麻、木薯2种植物的CCa MK具有较近的亲缘关系;在表达方面,Hb CCa MK1在橡胶树根中表达丰度最高,其次为树叶和花;另外,Hb CCa MK1的表达还与叶片发育、真菌侵染和低温胁迫有关。

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