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甜瓜CmRDR基因家族的鉴定及其对CGMMV侵染的表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李玉林 1 ; 王玉环 1 ; 姚依秀 1 ; 何艳军 1 ; 范敏 1 ; 高杰 1 ;

作者机构： 1.新疆农业大学林学与园艺学院;浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 甜瓜;RNA依赖性RNA聚合酶(RDR);黄瓜绿斑驳花叶病毒;基因表达;进化分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 009 期

页码： 2837-2846

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： RNA依赖性RNA聚合酶(RDRs)是RNA沉默途径中一类重要的蛋白,能够以单链核糖核酸(ssRNA)为模板合成双链核糖核酸(dsRNAs),启动新一轮的RNA沉默.众所周知,RDR基因在植物抵御病毒侵染中发挥重要的作用,而甜瓜作为一种易受到病害侵染的经济作物,其RDR基因的鉴定尚未见报道.因此,本研究利用生物信息学手段,在全基因组水平对甜瓜RDR基因进行了鉴定,分析其序列特征、亚细胞定位、进化关系和启动子上的逆境和激素响应元件.此外,利用RT-qPCR对甜瓜CmRDR基因的表达特征进行了分析,结果发现,接种黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)后,大部分甜瓜CmRDR基因的表达显著下调.本研究首次鉴定了甜瓜RDRs家族基因的特性,初步揭示了 CmRDR基因在CGMMV病毒响应中的功能,为后期甜瓜抗病育种提供了一定的理论依据.

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