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Rim2因子超级家族的分布及分子指纹技术在水稻品种鉴定中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 王建军 1 ; 王林友 1 ; 田平芳 2 ; 张礼霞 1 ; 张利华 1 ; 余庆生 1 ; 何祖华 2 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所

2.中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所

关键词: Oryzasativa;Rim2超级基因家族;基因分布;指纹;纯度鉴定

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1006-1304

年卷期: 2006 年 14 卷 01 期

页码: 69-73

收录情况: CSCD

摘要: 通过GenBank中230Mb水稻序列的对比分析,新鉴定的水稻Rim2因子家族编码亚组和假基因亚组不均匀地分布于12条染色体上,以着丝点区域分布频率为最高。由基因内缺失和插入使得Rim2因子序列多变,结合其众多的拷贝数尝试将其开发为一新的分子指纹。以水稻(Oryzasativassp.indica)品种R963及其育种亲缘材料为测试样本,尽管材料间可能存在极其相近的遗传背景,利用Rim2因子设计的5个引物,还是检测出材料间DNA水平的差异。采用同样引物,对2份杂交籼稻(O.sativassp.indica)和1份杂交粳稻(O.sativassp.japonica)组合及相应亲本的PCR检测,获得所有材料的特异指纹。Rim2因子可作为水稻品种鉴别的分子指纹,也可应用于杂交稻纯度的快速鉴定。

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