您好,欢迎访问北京市农林科学院 机构知识库!

普通小麦祖先种类TaNAC2a基因的鉴定分析和表达模式研究

文献类型: 中文期刊

作者: 张凤洁 1 ; 李雪垠 2 ; 高世庆 2 ; 冯变娥 1 ; 刘婷婷 1 ; 唐益苗 2 ; 赵昌平 2 ; 王爱萍 1 ;

作者机构: 1.山西农业大学农学院

2.北京杂交小麦工程技术研究中心

关键词: 乌拉尔图小麦;粗山羊草;NAC;生物信息学;表达特性

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2014 年 15 卷 05 期

页码: 1012-1022

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用生物信息学方法,利用核酸、蛋白数据库对普通小麦祖先种乌拉尔图小麦(Triticum urartu L.)和粗山羊草(Aegilops tauschii L.)NAC转录因子基因家族进行分析,分别鉴定出107、126个NAC蛋白家族成员。根据拟南芥、水稻NAC基因家族分类系统,将其分为15个亚族。通过与抗逆相关基因TaNAC2a进行同源进化树分析,发现5个TuNAC、6个AetNAC基因与其高度同源,对这些基因的蛋白结构域、基因结构、启动子顺式作用元件及组织表达特性进行分析。结果表明,11个NAC蛋白具有典型的NAC结构域。进化关系较近的基因具有相似基因结构;启动子区域预测发现其均含有逆境胁迫响应作用元件。实时荧光定量PCR结果显示,TuNAC、AetNAC基因分别在乌拉尔图小麦和粗山羊草根、胚芽鞘、叶组织中均有表达,并呈现出明显的组织表达特异性。通过芯片表达数据和逆境胁迫基因表达试验,推测AetNAC2c基因可能参与植物干旱胁迫响应,AetNAC2b可能参与调控植物的耐旱、耐低温胁迫反应。上述分析结果为普通小麦祖先种基因家族的系统研究,优异候选功能基因的预测、筛选提供了试验依据。

  • 相关文献

[1]TaNAC提高转基因烟草的抗旱功能. 刘美英,冶晓芳,唐益苗,高世庆,张朝,赵昌平,陈学平. 2010

[2]粗山羊草JAZ基因家族的全基因组鉴定与分析. 王玉昆,苑少华,苑国良,段文静,王鹏,廖祥政,陈兆波,王娜,王拯. 2016

[3]Characterization and primary functional analysis of a bamboo NAC gene targeted by miR164b. Wang, Lili,Zhao, Hansheng,Chen, Dongliang,Li, Lichao,Sun, Huayu,Lou, Yongfeng,Gao, Zhimin,Wang, Lili,Chen, Dongliang.

[4]小麦ARF基因家族生物信息学分析及在干旱胁迫下的表达特性研究. 孙仁玮,刘永杰,王翔,张荃,张立平,孙辉,王永波,高建刚,杨卫兵,赵昌平,高世庆,韩俊. 2018

[5]板栗PPO基因克隆及生物信息学分析. 程丽莉,程运河,兰彦平,曹庆昌,胡广隆,苏淑钗. 2020

[6]板栗STP家族基因鉴定与分析. 程运河,程丽莉,曹庆昌,兰彦平. 2020

[7]日本结缕草ZjHCT基因的克隆及转录自激活检测. 董笛,王焕英,滕珂,檀鹏辉,晁跃辉,韩烈保. 2019

[8]辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析. 张烨达,王星,王丽萍,佟静,武占会,高彦魁. 2023

[9]毛百合LiGPAT基因3'端与5'端克隆及其序列分析. 相恒佐,苗琰,陈丽静,王利,张丽. 2013

[10]可可毛色二孢效应子LT_397基因的克隆及转录分析. 曹阳,邢启凯,李铃仙,徐品三. 2021

[11]可可毛色二孢全基因组分泌蛋白的预测及分析. 邢启凯,李铃仙,曹阳,张玮,彭军波,燕继晔,李兴红. 2020

[12]毛白杨BABY BOOM基因的克隆及生物信息学分析. 杨紫彤,姜廷波,魏建华,丁莉萍. 2021

[13]大葱4-香豆酸辅酶A连接酶基因Af4CL的克隆及表达分析. 李逸,徐欢欢,张宇辰,王永勤,刘乐承. 2023

[14]杏NBS基因家族鉴定及其对果实抗病性的影响. 秦兆辉,张俊环,杨丽,张美玲,王玉柱,姜凤超,孙浩元. 2022

作者其他论文 更多>>