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甘蔗和斑茅Ⅲ型过氧化物酶基因(SoPOD-1和SaPOD-1)cDNA克隆与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡小文 1 ; 姚艳丽 1 ; 邢淑莲 1 ; 徐磊 1 ; 刘洋 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院湛江实验站

关键词: 甘蔗;斑茅;Ⅲ过氧化物酶基因;基因克隆

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2015 年 31 卷 36 期

页码: 139-144

收录情况: CSCD

摘要: 研究旨在通过克隆甘蔗和斑茅Ⅲ型过氧化物酶基因(Prxs),分析比较2个物种Prxs基因差异,探讨2个物种Prxs功能差异的遗传基础。采用同源克隆方法,以高粱Prxs基因序列为探针,克隆获得甘蔗和斑茅Prxs基因。本研究从斑茅和甘蔗中成功克隆获得了4个Prxs基因c DNA序列,其中斑茅2个基因长度均为1083 bp,存在一个差异位点,甘蔗2个基因长度均为1084 bp,存在11个碱基差异。4个基因开放阅读框均为996 bp,编码331个氨基酸。蛋白质保守结构域分析表明,克隆获得的4个基因均具有Prxs典型保守结构域,为目标基因。系统进化分析表明,克隆获得的基因与高粱、玉米和水稻的同源基因相似性最高,在一些双子叶植物,甚至裸子植物也能找到其同源基因,且氨基酸序列的相似程度与物种分化的程度基本一致,可供植物分类作参考。该试验从斑茅和甘蔗中成功克隆获得了4个Prxs基因c DNA序列,为深入研究Prxs基因在不同植物中功能差异提供了一定的参考。

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