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亚麻COBRA基因家族的鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 齐燕妮 1 ; 李闻娟 1 ; 王利民 1 ; 赵玮 1 ; 党照 1 ; 谢亚萍 1 ; 张建平 1 ;

作者机构： 1.甘肃省农业科学院作物研究所

关键词： 亚麻;纤维;COBRA基因家族;序列分析;系统进化分析

期刊名称： 甘肃农业科技

ISSN： 1001-1463

年卷期： 2019 年 009 期

页码： 33-38

摘要： COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子.亚麻纤维为韧皮纤维,纤维产量与次生壁中纤维素含量及次生壁加厚密切相关.通过BLASTP和Pfam分析,鉴定到24个亚麻COBRA家族成员,并对其进行基因结构、蛋白理化性质及系统进化等生物信息学分析.结果表明,有22个成员具有跨膜结构域,21个成员具有N-端信号肽,16个成员具有GPI锚定位点,所有蛋白均具有CCVS保守结构域而且都定位在细胞膜.基因结构和系统进化分析表明,亚麻COBRA基因家族分为2个亚家族:COBRA-I和COBRA-II,2个亚家族的基因结构具有明显的差异.

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