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杧果FPPS基因的鉴定和序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 盖江涛 1 ; 朱敏 1 ; 党志国 1 ; 陈华蕊 1 ; 陈振玺 1 ; 王鹏 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 杧果;萜类;法尼基焦磷酸合成酶;系统进化;生物信息学

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2016 年 43 卷 06 期

页码： 69-75+2

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 法尼基焦磷酸合成酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS,EC∶2.5.1.1)是倍半萜合成中的一个关键酶,在植物萜类合成过程中有关键作用。以杧果FPPS基因为研究对象,以拟南芥FPPS基因为参考,通过BLAST方法从番木瓜、金钱橘、甜橙、苹果、小果野蕉、桃子、白梨、葡萄、中华猕猴桃、无油樟基因组数据中获得了FPPS基因,共19条FPPS基因序列,对其进行了系统进化分析和生物信息学分析。系统进化结果显示:双子叶植物纲果树与单子叶植物纲果树关系较远,同是双子叶植物纲的果树关系较近,同科果树亲缘关系更近。生物信息学分析结果显示:氨基酸序列中,酸性蛋白占94.7%,稳定性蛋白占84.2%,有信号肽的蛋白占5.3%,有导肽的蛋白占10.5%,所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;所有FPPS基因亚细胞定位于线粒体中,均有蛋白活性位点。

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