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蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄启星 1 ; 郭安平 2 ; 杨礼富 1 ; 邹智 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

关键词: 蓖麻;WRKY;转录因子;电子克隆;生物信息学分析

期刊名称: 热带生物学报

ISSN: 1674-7054

年卷期: 2012 年 3 卷 04 期

页码: 305-313

摘要: 基于已公布的蓖麻基因组序列,利用电子克隆技术纠正了拼接错误的WRKY基因序列,获得蓖麻WRKY14基因信息。结果表明:该基因含有3个内含子,编码318个氨基酸的多肽,理论相对分子质量为35.49×103,等电点为8.64,总平均亲水性为-0.803,不稳定系数为46.88,核定位,属于不稳定的亲水性核定位蛋白;该蛋白含有1个WRKY结构域,其基序为WRKYGQK_X13_C_X5_C_X23_H_X1_H,保守内含子位于199位的K和200位的V之间,可归为Ⅱ大类a亚类;RcWRKY14的启动子区含有多种激素和胁迫应答相关元件RcWRKY14在叶片、花、胚乳和种子中都有表达,其中在花中的表达量最高,种子和叶片中次之,胚乳中最低。

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